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例如，磷酸特异性抗体可能只与活化的磷酸化蛋白发生反应。如果您的蛋白定位在胞内，则必须对细胞进行裂解。流式细胞实验可能要选择识别细胞表面分子的抗体。如果您的蛋白有三级结构，且掩盖了抗原表位，则必须对样本进行变性，因为有些抗体无法识别
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流式细胞术前沿过去10年已见证了微毛细管流式细胞术的***应用;相较于基于鞘液的传统流式经脆分析仪，它使用更小的样品体积和更少的试剂，产生更少的废弃物，具有更任的操作成本。流式细胞术还被进一步微型化为超紧凑的个人型流式细胞分析仪。
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